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衙门的最高职位因朝代和机构不同而有所差异，以下是主要朝代的典型代表：
一、中央层面
负责一省或多省军政事务，是地方最高行政长官（如两江总督、直隶总督）。
内阁大学士/大学士
明清两代中枢决策机构成员，辅佐皇帝处理政务，实际权力较大。
二、地方行政体系
总督（一省）
- 职责： 军政事务（如两江总督）或民政财政（如浙江巡抚）。 - 地位
负责一省民政、财政等事务，权力次之。
布政使
主管一省财政、人事等行政事务，相当于现代省长。
按察使
职掌一省司法、监察，相当于现代司法厅长。
道员
介于省与府之间，负责专项事务（如粮道、盐道）。
县级衙门
知县： 县最高行政负责人，主管行政和法律事务。 副职
三、特殊机构
清代中枢机构成员，统领文职官员选拔与事务审核，品级正三品，后提升至正二品。
九门提督
清代京师军事机构负责人，统帅内城九座城门守卫及京师治安，品级从一品。 - 职责： 包括门禁管理、巡夜、缉捕、断狱等，实际掌握京师军事与治安大权。 总结
衙门最高职位需结合具体行政层级判断：
省级及以上：总督、内阁大学士；
地方行政核心：总督、巡抚、布政使；
京师军事：九门提督。若问题特指地方行政体系，则 知县为县级衙门最高职位；若涉及中央或军事机构，则需进一步明确范围。
